RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPRYD7Q5W111 196 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMC4Q7Z404 712 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 EYA3Q99504 573 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 GGA1Q9UJY5 639 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L3A6NCW0 530 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L4A6NCW7 530 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 FKBP1BP68106 108 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRHR2Q13324 411 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEUROD2Q15784 382 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFNL1Q8IU54 200 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CERS5Q8N5B7 392 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXW7Q969H0 707 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPN18Q99952 460 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPRFP10586 1907 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHL1O00533 1208 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARMC5Q96C12 935 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 WNK4Q96J92 1243 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYD88Q99836 296 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 JAG2Q9Y219 1238 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 MED23Q9ULK4 1368 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 XDHP47989 1333 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 AK9Q5TCS8 1911 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 H0YGN5 161 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 GCC1Q96CN9 775 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 SHISA4Q96DD7 197 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 OTUD5Q96G74 571 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 GREM2Q9H772 168 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLRN2A0PK11 232 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 G3V3G9 751 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV5-2P06315 115 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 CTGFP29279 349 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 SREBF2Q12772 1141 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF333Q96JL9 665 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 MBIPQ9NS73 344 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 CACNA1FO60840 1977 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDE8AO60658 829 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 CTSWP56202 376 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 GTF2IP78347 998 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 PODNQ7Z5L7 613 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHIPQ8WWQ0 1821 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 F8W031 263 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEFMP07197 916 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP2B4P23634 1241 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTFR1Q15390 333 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP3K11Q16584 847 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-171P-201ENST00000384354 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms