RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.42■■□□□ 1.18
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SYP-202ENST00000376303 USP17L8P0C7I0 530 aa22.41■■□□□ 1.18
SYP-202ENST00000376303 SULF1Q8IWU6 871 aa22.41■■□□□ 1.18
SYP-202ENST00000376303 GGA3Q9NZ52 723 aa22.41■■□□□ 1.18
SYP-202ENST00000376303 F6X3S4 739 aa22.4■■□□□ 1.18
SYP-202ENST00000376303 HUNKP57058 714 aa22.4■■□□□ 1.18
SYP-202ENST00000376303 BEND3Q5T5X7 828 aa22.4■■□□□ 1.18
SYP-202ENST00000376303 DLK2Q6UY11 383 aa22.4■■□□□ 1.18
SYP-202ENST00000376303 COA1Q9GZY4 146 aa22.4■■□□□ 1.18
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SYP-202ENST00000376303 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.37■■□□□ 1.17
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SYP-202ENST00000376303 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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SYP-202ENST00000376303 FOXO4P98177 505 aa22.36■■□□□ 1.17
SYP-202ENST00000376303 CHRNDQ07001 517 aa22.36■■□□□ 1.17
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SYP-202ENST00000376303 RGMBQ6NW40 437 aa22.35■■□□□ 1.17
SYP-202ENST00000376303 OGFOD1Q8N543 542 aa22.35■■□□□ 1.17
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SYP-202ENST00000376303 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.34■■□□□ 1.17
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SYP-202ENST00000376303 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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SYP-202ENST00000376303 MXD3Q9BW11 206 aa22.32■■□□□ 1.16
SYP-202ENST00000376303 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.32■■□□□ 1.16
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SYP-202ENST00000376303 CD209Q9NNX6 404 aa22.29■■□□□ 1.16
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SYP-202ENST00000376303 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.28■■□□□ 1.16
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SYP-202ENST00000376303 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
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SYP-202ENST00000376303 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.24■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 SASH1O94885 1247 aa22.23■■□□□ 1.15
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SYP-202ENST00000376303 PLIN1O60240 522 aa22.22■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 NF2P35240 595 aa22.22■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 KAZALD1Q96I82 304 aa22.22■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 SLFN5Q08AF3 891 aa22.21■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.21■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.21■■□□□ 1.15
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