RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 ARAP2Q8WZ64 1704 aa34.12■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa34.11■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP34.11■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 MED23Q9ULK4 1368 aa34.1■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 XAGE2Q96GT9 111 aa34.09■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 TAOK3Q9H2K8 898 aa34.08■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 GORABQ5T7V8 394 aa34.08■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 WASHC4Q2M389 1173 aa34.07■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 CAVIN4Q5BKX8 364 aa34.07■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 DBNDD2Q9BQY9 259 aa34.07■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 LTBP3Q9NS15 1303 aa34.06■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP34.06■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 ADORA1P30542 326 aa34.06■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 GPR162Q16538 588 aa34.06■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 VPS33BQ9H267 617 aa34.06■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 IRS2Q9Y4H2 1338 aa34.05■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 GPATCH3Q96I76 525 aa34.05■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 NFKBIEO00221 500 aa34.04■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 KLRK1P26718 216 aa34.04■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC158Q5M9N0 1113 aa34.03■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 VPS37DQ86XT2 251 aa34.03■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa34.03■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF804AQ7Z570 1209 aa34.03■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 TXNRD3Q86VQ6 643 aa34.03■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 MX1P20591 662 aa34.02■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 GYG1P46976 350 aa34.02■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA2012Q0VF49 1180 aa34.02■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 RIMBP2O15034 1052 aa34.01■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
GIPC1-201ENST00000345425 PPIP5K2O43314 1243 aa34■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC102BQ68D86 513 aa34■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO33Q7Z6M2 555 aa34■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 SALL3Q9BXA9 1300 aa34■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 GRIN3BO60391 1043 aa34■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 TTC41PQ6P2S7 1318 aa33.99■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 PDE4AP27815 886 aa33.99■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 BCAMP50895 628 aa33.99■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 TTC39AQ5SRH9 613 aa33.99■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 ECHDC1Q9NTX5 307 aa33.99■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 IARSP41252 1262 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 AOC3Q16853 763 aa33.98■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 G3V3G9 751 aa33.98■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 PHKA1P46020 1223 aa33.98■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 DCAF8Q5TAQ9 597 aa33.98■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 COA1Q9GZY4 146 aa33.98■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa33.97■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 RASSF7Q02833 373 aa33.97■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 PDE1AP54750 535 aa33.96■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa33.96■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 LARGE2Q8N3Y3 721 aa33.96■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 STAP2Q9UGK3 403 aa33.96■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
GIPC1-201ENST00000345425 ERC2O15083 957 aa33.95■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 OSBPL3Q9H4L5 887 aa33.94■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 CD209Q9NNX6 404 aa33.94■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 AOX1Q06278 1338 aa33.94■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 ATP5JP18859 108 aa33.93■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 SEMA3EO15041 775 aa33.92■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB22O15209 634 aa33.92■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 IL1R1P14778 569 aa33.92■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 DOK7Q18PE1 504 aa33.92■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 PODNQ7Z5L7 613 aa33.92■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP33.92■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 DCAF8L1A6NGE4 600 aa33.91■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 LMNB1P20700 586 aa33.91■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 DBNDD1Q9H9R9 158 aa33.91■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 RGS3P49796 1198 aa33.9■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 TSHZ3Q63HK5 1081 aa33.9■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 NIM1KQ8IY84 436 aa33.9■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 JDP2Q8WYK2 163 aa33.9■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 ECE2O60344 883 aa33.9■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 DENND2AQ9ULE3 1009 aa33.9■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa33.89■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 MYH13Q9UKX3 1938 aa33.89■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 SKAP1Q86WV1 359 aa33.89■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 PI4K2BQ8TCG2 481 aa33.89■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
GIPC1-201ENST00000345425 SBF1O95248 1867 aa33.88■■■■□ 3.01
GIPC1-201ENST00000345425 RASGRF1Q13972 1273 aa33.88■■■■□ 3.01
GIPC1-201ENST00000345425 MCAMP43121 646 aa33.87■■■■□ 3.01
GIPC1-201ENST00000345425 BOLA2Q9H3K6 86 aa33.87■■■■□ 3.01
GIPC1-201ENST00000345425 PRELPP51888 382 aa33.86■■■■□ 3.01
GIPC1-201ENST00000345425 CHD4Q14839 1912 aa33.86■■■■□ 3.01
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