RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.26■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.25■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.25■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 SRGAP3O43295 1099 aa26.25■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 CREBZFQ9NS37 354 aa26.25■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.25■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 EYA2O00167 538 aa26.24■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 ECE2O60344 883 aa26.24■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.24■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.24■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.23■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 CXCL9Q07325 125 aa26.23■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.23■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 SIL1Q9H173 461 aa26.23■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 KCNJ4P48050 445 aa26.22■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 METTL24Q5JXM2 366 aa26.22■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.22■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 COPRSQ9NQ92 184 aa26.22■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 RAD17O75943 681 aa26.21■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.21■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 SCN4AP35499 1836 aa26.21■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 PASKQ96RG2 1323 aa26.2■■□□□ 1.79
COX5B-201ENST00000258424 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 CIAO1O76071 339 aa26.19■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 ATP8B2P98198 1209 aa26.19■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.19■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 POLA2Q14181 598 aa26.18■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.18■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 CEP85Q6P2H3 762 aa26.18■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 FBXO3Q9UK99 471 aa26.18■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 G3V3G9 751 aa26.17■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 PDE8BO95263 885 aa26.17■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 UBE4AQ14139 1066 aa26.17■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.17■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 CNTROBQ8N137 903 aa26.17■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 SSH3Q8TE77 659 aa26.17■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.16■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 PSMD14O00487 310 aa26.15■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 COA1Q9GZY4 146 aa26.15■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.14■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 EPS15P42566 896 aa26.14■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 SCNN1DP51172 638 aa26.14■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 TNIP1Q15025 636 aa26.14■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 PODNQ7Z5L7 613 aa26.14■■□□□ 1.78
COX5B-201ENST00000258424 FGFR2P21802 821 aa26.13■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 CD209Q9NNX6 404 aa26.12■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 GYG1P46976 350 aa26.11■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.11■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.1■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 CNTNAP1P78357 1384 aa26.09■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 TFCP2Q12800 502 aa26.09■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.09■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.09■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.09■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.08■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 SHTN1A0MZ66 631 aa26.08■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 USP17L3A6NCW0 530 aa26.08■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 USP17L4A6NCW7 530 aa26.08■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 IL1R1P14778 569 aa26.08■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 ATP2B3Q16720 1220 aa26.08■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.08■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 CRBNQ96SW2 442 aa26.08■■□□□ 1.77
COX5B-201ENST00000258424 ZNF609O15014 1411 aa26.07■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 SASH1O94885 1247 aa26.07■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.763e-7■■■■□ 21.2
COX5B-201ENST00000258424 DACT2Q5SW24 774 aa26.07■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 LPIN2Q92539 896 aa26.07■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 MXD3Q9BW11 206 aa26.07■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 SLC5A1P13866 664 aa26.06■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.06■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 FBXW7Q969H0 707 aa26.06■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 VEGFBP49765 207 aa26.05■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 GTF2IP78347 998 aa26.05■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.05■■□□□ 1.76
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