RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.24■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.24■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 KRT32Q14532 448 aa22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FERMT3Q86UX7 667 aa22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 CAMTA2O94983 1202 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 Q6ZUG5 572 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 RNF214Q8ND24 703 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 XAGE2Q96GT9 111 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 MAST3O60307 1309 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 CSF1RP07333 972 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 SCARF1Q14162 830 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.22■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 M0R2C6 588 aa22.21■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.21■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 GREM2Q9H772 168 aa22.21■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.21■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.2■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 GORABQ5T7V8 394 aa22.2■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.2■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 SMIM5Q71RC9 77 aa22.2■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 JAK2O60674 1132 aa22.2■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 PI16Q6UXB8 463 aa22.2■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ESPNB1AK53 854 aa22.19■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TRIM37O94972 964 aa22.19■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.19■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.19■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM177BA6PVY3 158 aa22.19■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ITGA6P23229 1130 aa22.19■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 UBE2HP62256 183 aa22.19■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.18■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.18■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.18■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 BRF1Q92994 677 aa22.18■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 OSBP2Q969R2 916 aa22.18■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 GTF3C6Q969F1 213 aa22.18■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.18■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.18■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TSPY26PQ9H489 355 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ZAP70P43403 619 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 CTSWP56202 376 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 METTL24Q5JXM2 366 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SUSD4Q5VX71 490 aa22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.16■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 GNPATO15228 680 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 FGD1P98174 961 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 FBXO3Q9UK99 471 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 LY75O60449 1722 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 CHST3Q7LGC8 479 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.15■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 RPS6KA4O75676 772 aa22.14■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 CLCN1P35523 988 aa22.14■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SCRN1Q12765 414 aa22.14■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP2B3Q16720 1220 aa22.14■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.14■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX11Q96FC9 970 aa22.14■■□□□ 1.14
PDLIM4-201ENST00000253754 E7EWF7 191 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 FOXP2O15409 715 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 PDCP20941 246 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 WASHC4Q2M389 1173 aa22.14■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 PHF14O94880 888 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 APOBRQ0VD83 1088 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 PARP10Q53GL7 1025 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 TTC6Q86TZ1 520 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.13■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 MYH3P11055 1940 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 PDE8AO60658 829 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.12■■□□□ 1.13
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