RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
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PRRX1-201ENST00000239461 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PRRX1-201ENST00000239461 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.56□□□□□ -0.4
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PRRX1-201ENST00000239461 NFXL1Q6ZNB6 911 aa12.52□□□□□ -0.41
PRRX1-201ENST00000239461 ERICH2A1L162 156 aa12.51□□□□□ -0.41
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PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa12.5□□□□□ -0.41
PRRX1-201ENST00000239461 EP400Q96L91 3159 aa12.5□□□□□ -0.41
PRRX1-201ENST00000239461 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.5□□□□□ -0.41
PRRX1-201ENST00000239461 LTBP1Q14766 1721 aa12.5□□□□□ -0.41
PRRX1-201ENST00000239461 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PRRX1-201ENST00000239461 SETDB2Q96T68 719 aa12.5□□□□□ -0.41
PRRX1-201ENST00000239461 MROH5Q6ZUA9 1318 aa12.5□□□□□ -0.41
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