RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Taf5lQ91WQ5 589 aa22.75■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CfhP06909 1234 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prl3d1P18121 224 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fam84aQ9D650 292 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mast3Q3U214 1321 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Terf1P70371 421 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NogP97466 232 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Letm1Q9Z2I0 738 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Usp17lbE9Q9U0 468 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf428Q8C1M2 176 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TnksQ6PFX9 1320 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Psmd1Q3TXS7 953 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vps54Q5SPW0 977 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zcwpw1Q6IR42 630 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Glis3Q6XP49 780 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dbr1Q923B1 550 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trmt44Q9D2Q2 713 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ly6iQ9WU67 134 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CbarpQ66L44 698 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf18Q810A1 556 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spon1Q8VCC9 807 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Psme4Q5SSW2 1843 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Akap2O54931 893 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 XpcP51612 930 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 AaasP58742 546 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc7a3P70423 618 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nell2Q61220 819 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pram1Q6BCL1 675 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kif18aQ91WD7 886 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ube3bQ9ES34 1070 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zkscan2G3X952 960 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kifc2O08672 792 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prl7d1P04769 244 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hmox1P14901 289 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rhot2Q8JZN7 620 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rdm1Q9CQK3 281 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scn9aQ62205 1984 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Glt1d1A4FUP9 346 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Map7O88735 730 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fam83bQ0VBM2 1012 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 ZyxQ62523 564 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nme8Q715T0 586 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myh13B1AR69 1938 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Wdr63B2RY71 923 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mapkapk5O54992 473 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myh3P13541 1940 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CpdO89001 1377 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pnmal2G3X9N3 661 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc4a3P16283 1227 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 EspnlQ3UYR4 1005 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kif22Q3V300 660 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 B4galnt3Q6L8S8 986 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Polr3dQ91WD1 398 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Glrx3Q9CQM9 337 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ecm29Q6PDI5 1840 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Map9Q3TRR0 646 aa22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc44a4Q91VA1 707 aa22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Col1a1P11087 1453 aa22.64■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eif6O55135 245 aa22.64■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pde3bQ61409 1100 aa22.64■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Golim4Q8BXA1 655 aa22.64■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa22.64■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mroh6V9GX81 722 aa22.64■■□□□ 1.22
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tuft1O08970 390 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrch1P62046 709 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccdc93Q7TQK5 629 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ube3cQ80U95 1083 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Brf1Q8CFK2 676 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Supt16hQ920B9 1047 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 EspnQ9ET47 871 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfp646Q6NV66 1788 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stat5bP42232 786 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Usp48Q3V0C5 1052 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NsmfQ99NF2 532 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stag1Q9D3E6 1258 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stk32bQ9JJX8 414 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ifi207E9Q3L4 978 aa22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Psmd14O35593 310 aa22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mical3Q8CJ19 1993 aa22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm2163Q6PCY5 473 aa22.6■■□□□ 1.21
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cog6Q8R3I3 657 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.9 ms