RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641815.1

STX3-208, Transcript of syntaxin 3, human

BASIC

Gene STX3, Length 3,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX3-208	ENST00000641815	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	MGMT	P16455	207 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CD82	P27701	267 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	AGTR1	P30556	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GDNF	P39905	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OPRD1	P41143	372 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FAM3A	P98173	230 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TLE4	Q04727	773 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67	8e-7	■■■■□ 25.3
STX3-208	ENST00000641815	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	EFNB3	Q15768	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	LAT	O43561	262 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CLDN7	O95471	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	APOC3	P02656	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	WNT1	P04628	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ATP1B1	P05026	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	EPHA1	P21709	976 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RFC3	P40938	356 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ATP1B3	P54709	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ADPRH	P54922	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	DGCR2	P98153	550 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	NFATC4	Q14934	902 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SVBP	Q8N300	66 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RASL12	Q9NYN1	266 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	LEFTY2	O00292	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	HMGN4	O00479	90 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF217	O75362	1048 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ATG12	O94817	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	NDUFB6	O95139	128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	MT-ND4	P03905	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	PAX6	P26367	422 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SHC1	P29353	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	PRKX	P51817	358 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RUNX3	Q13761	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF345	Q14585	488 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815		Q6ZTK2	550 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms