RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	C1orf198	Q9H425	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	FXYD1	O00168	92 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	RHOD	O00212	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	IMPA2	O14732	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TSPAN4	O14817	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ANGPT2	O15123	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	PTH	P01270	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	IFI30	P13284	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	OMG	P23515	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	PSG7	Q13046	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TAF11	Q15544	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	VCX	Q9H320	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	NPTN	Q9Y639	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A0G2JND7	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658		J3QLI3	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ENTPD5	O75356	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	VHL	P40337	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF154	Q13106	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	FHL1	Q13642	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	MIDN	Q504T8	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A0A0MQY5	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-240	ENST00000641658	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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