RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 DGCR6Q14129 220 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHDC1Q8N7A1 406 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SGCDQ92629 289 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM162AQ96A26 154 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP6Q96JE9 813 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BUX3 64 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LY6EQ16553 131 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DPY19L4Q7Z388 723 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ARPINQ7Z6K5 226 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SDR9C7Q8NEX9 313 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 RCN3Q96D15 328 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 IFT27Q9BW83 186 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ANOS1P23352 680 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS27P42677 84 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 EFNB2P52799 333 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC10Q5BKY1 277 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52J3Q8NH60 311 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 COPS4Q9BT78 406 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DCTN5Q9BTE1 182 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNG2Q9UJ96 466 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOT8O14734 319 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A1P11166 492 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKXP51817 358 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 GMFBP60983 142 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CSNK2BP67870 215 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC23BQ15437 767 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF13Q15543 124 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OXLD1Q5BKU9 147 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf88Q6PI97 169 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 DRAM2Q6UX65 266 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB46Q86UZ6 589 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 LYG1Q8N1E2 194 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N7P7 452 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T6Q8NHC8 308 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ITPKCQ96DU7 683 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SEH1LQ96EE3 360 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CLPTM1LQ96KA5 538 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52D1Q9H346 318 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SAR1AQ9NR31 198 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 VSIG10L2P0DP72 767 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4C15Q8NGM1 316 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R35Q8TAP8 253 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 DMRTB1Q96MA1 342 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OPA3Q9H6K4 179 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6C68A6NDL8 312 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ARPC3O15145 178 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TBX1O43435 398 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 XPNPEP2O43895 674 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 DIRAS1O95057 198 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2E1P51965 193 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A2P52569 658 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT72Q14CN4 511 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NCR3LG1Q68D85 454 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5T2Q8NGG2 359 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51G2Q8NGK0 314 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SSX3Q99909 188 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM234AQ9H0X4 552 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NECAP2Q9NVZ3 263 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQ09 198 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TVP23AA6NH52 213 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NKX6-3A6NJ46 265 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SELLP14151 372 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NCK1P16333 377 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 RHCEP18577 417 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PYCR1P32322 319 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DS4P43632 304 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PGBD2Q6P3X8 592 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR82Q6UXN9 313 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR86Q86TI4 376 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 BEND2Q8NDZ0 799 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PROKR2Q8NFJ6 384 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1M1Q8NGA1 313 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4S1Q8NGB4 309 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CFHR4Q92496 578 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF14Q92956 283 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPMQ9NSP4 180 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFAF4Q9P032 175 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 XRCC2O43543 280 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 POU1F1P28069 291 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 DDOSTP39656 456 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSM1Q08AH1 577 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 BLMHQ13867 455 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf53Q8IXP5 236 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SNTG1Q9NSN8 517 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 MAB21L2Q9Y586 359 aa22.35■■□□□ 1.17
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