RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TP53I11O14683 189 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SOCS1O15524 211 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SFT2D2O95562 160 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 WDPCPO95876 746 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GP1BAP07359 652 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 NAT2P11245 290 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF43P17038 809 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FPR2P25090 351 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSMB6P28072 239 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 AVPR2P30518 371 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDAP32320 146 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR3A4PP47883 348 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 STARP49675 285 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 NAAAQ02083 359 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ECH1Q13011 328 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCOLCEQ15113 449 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPA1Q15181 289 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 LCN10Q6JVE6 187 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GUSBP11Q6P575 273 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 UQCC3Q6UW78 93 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMPPEQ6ZT21 453 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM104Q8NE00 496 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM230Q96A57 120 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SOX7Q9BT81 388 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 WDR54Q9H977 334 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 C5orf42Q9H799 3197 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A0U1RQV5 110 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAB19A4D1S5 217 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RER1O15258 196 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAMP1O60894 148 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAD51DO75771 328 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 HCKP08631 526 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FGF5P12034 268 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 AKR1C4P17516 323 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CNR1P21554 472 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SERPINF1P36955 418 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CXCL12P48061 93 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 H3F3AP84243 136 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 BTN1A1Q13410 526 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARL6IP1Q15041 203 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CARD17Q5XLA6 110 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM57BQ71RH2 274 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM17Q86X19 198 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 C10orf35Q96D05 121 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 LYZL4Q96KX0 146 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNF126Q9BV68 326 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TM2D1Q9BX74 207 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM117AQ9C073 453 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR10A2Q9H208 303 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PIGMQ9H3S5 423 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAB18Q9NP72 206 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 MBD2Q9UBB5 411 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.46□□□□□ -1.05
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