RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598086.5

FCHO1-224, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-224	ENST00000598086	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	GINS1	Q14691	196 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	KLB	Q86Z14	1044 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	MRI1	Q9BV20	369 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	IL20	Q9NYY1	176 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086		M0R129	80 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086		M0R135	149 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF823	P16415	610 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	GRK5	P34947	590 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	TPTE	P56180	551 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	CDK5	Q00535	292 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	PAX2	Q02962	417 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	PAX8	Q06710	450 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	MALL	Q13021	153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	PGAP1	Q75T13	922 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	C3orf56	Q8N813	242 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF799	Q96GE5	643 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	LRRC30	A6NM36	301 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC1A7	O00341	560 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	CCDC159	P0C7I6	412 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	CA6	P23280	308 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	CD200	P41217	278 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	GATA4	P43694	442 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	GNB2	P62879	340 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF92	Q03936	586 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	MPPED2	Q15777	294 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	DOK3	Q7L591	496 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	OR2T4	Q8NH00	348 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	APH1B	Q8WW43	257 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SPTSSA	Q969W0	71 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	MIOX	Q9UGB7	285 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	FAM20B	O75063	409 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	HMGN1	P05114	100 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	GYPB	P06028	91 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SPARC	P09486	303 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	CLU	P10909	449 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	GABRB1	P18505	474 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	FMO3	P31513	532 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	CXCR4	P61073	352 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	CRMP1	Q14194	572 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	OR8G1	Q15617	311 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	SNAPC1	Q16533	368 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-224	ENST00000598086	LNX2	Q8N448	690 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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