RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 CD37P11049 281 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 ADRA2CP18825 462 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB3AP20336 220 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A5P33763 92 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 GSK3AP49840 483 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 GLT8D1Q68CQ7 371 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF101Q8IZC7 436 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1M1Q8NGA1 313 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 CHST5Q9GZS9 411 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 SMURF1Q9HCE7 757 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM138Q9NPI0 162 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 AIPO00170 330 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 SMPD2O60906 423 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 NGFP01138 241 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 GFI1Q99684 422 aa26.8■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 SULT1B1O43704 296 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 BDKRB2P30411 391 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 RANBP1P43487 201 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 IDNKQ5T6J7 187 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH26Q8IXH8 852 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC30A2Q9BRI3 323 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 MOGQ16653 247 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR7Q8TB68 274 aa26.78■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 B8ZZF3 427 aa26.77■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 DDI2Q5TDH0 399 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXW12Q6X9E4 464 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT74Q7RTS7 529 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 FTMTQ8N4E7 242 aa26.77■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 TECTBQ96PL2 329 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 NEK6Q9HC98 313 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 PTTG3PQ9NZH4 202 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa26.76■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 SCAND1P57086 179 aa26.76■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 NAAAQ02083 359 aa26.76■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 OR13C9Q8NGT0 318 aa26.76■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa26.75■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF83P51522 516 aa26.75■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 OR51A2Q8NGJ7 313 aa26.75■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 AGAP20933 346 aa26.74■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 CLVS2Q5SYC1 327 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 WDFY2Q96P53 400 aa26.74■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ16Q9NPI9 418 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 NPAP1Q9NZP6 1156 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNN3Q9UGI6 736 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SPEF1Q9Y4P9 236 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R1B8 84 aa26.74■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 CAPZA1P52907 286 aa26.74■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 UQCC2Q9BRT2 126 aa26.74■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 GGT3PA6NGU5 568 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM90A27PA6NNH2 459 aa26.73■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 CALCBP10092 127 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 RAC2P15153 192 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1J1Q8NGS3 322 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGTQ969N2 578 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SPSB1Q96BD6 273 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 CMTM3Q96MX0 182 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 STEAP1Q9UHE8 339 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM30Q9UKF2 790 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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