RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF814B7Z6K7 855 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDOBP05062 364 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CSNK1A1P48729 337 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 MTFR2Q6P444 385 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CORO6Q6QEF8 472 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF767PQ75MW2 155 aa22.33■■□□□ 1.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR1M1Q8NGA1 313 aa22.33■■□□□ 1.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 GPR137Q96N19 417 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 FABP7O15540 132 aa22.33■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 TAF13Q15543 124 aa22.33■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 KRTCAP3Q53RY4 240 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6N1Q8NGY5 312 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF835Q9Y2P0 537 aa22.33■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 SSNA1O43805 119 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 P04436 131 aa22.32■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN17P56750 224 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R19P59542 299 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G7Q13093 441 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM255AQ5JRV8 349 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 RAET1LQ5VY80 246 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP77Q6ZQR2 320 aa22.32■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF222Q9UK12 451 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL21O00585 134 aa22.31■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 NME2P22392 152 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB561P49447 251 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H3AP68431 136 aa22.31■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST2H3AQ71DI3 136 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ASB13Q8WXK3 278 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 FGGYQ96C11 551 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 NELFAQ9H3P2 528 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPA3F8WFD2 350 aa22.3■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR2W3Q7Z3T1 314 aa22.3■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR9K2Q8NGE7 335 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51A2Q8NGJ7 313 aa22.3■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP64Q9NPA5 681 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 PLSCR3Q9NRY6 295 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 UPB1Q9UBR1 384 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ALPK2Q86TB3 2170 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPOCK1Q08629 439 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 C3AR1Q16581 482 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF626Q68DY1 528 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZSR3 168 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 BIVMQ86UB2 503 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM123Q8N131 208 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 GJC3Q8NFK1 279 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4C16Q8NGL9 310 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10A4Q9H209 315 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO7BQ6PIF6 2116 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BSH0 61 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC01387J3KSC0 135 aa22.29■■□□□ 1.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 ALX3O95076 343 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF20P17024 532 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 RCVRNP35243 200 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ZMYND11Q15326 602 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 Q5BKY6 102 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1J2Q8NGS2 313 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM46BQ96A09 425 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 SEH1LQ96EE3 360 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 GNRHR2Q96P88 292 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa22.29■■□□□ 1.16
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