RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569252.5

USB1-215, Transcript of U6 snRNA biogenesis phosphodiesterase 1, human

TSL 4

Gene USB1, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USB1-215	ENST00000569252	DNASE1	P24855	282 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	WDR38	Q5JTN6	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	DOK3	Q7L591	496 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	NINJ1	Q92982	152 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	POFUT1	Q9H488	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TMEM100	Q9NV29	134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252		A0A1W2PPR1	153 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252		M0R233	179 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TTR	P02766	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ADRA2A	P08913	450 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	KITLG	P21583	273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TNFSF4	P23510	183 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	GNAL	P38405	381 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MPV17	P39210	176 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MAP2K4	P45985	399 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	GSK3A	P49840	483 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	FAM3A	P98173	230 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	BDH1	Q02338	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SLC3A1	Q07837	685 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	IRF3	Q14653	427 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	UFD1	Q92890	307 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MDFI	Q99750	246 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252		E9PI62	339 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OGG1	O15527	345 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SERPINA3	P01011	423 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ISG15	P05161	165 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	DANCR	P0C864	163 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CEL	P19835	753 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZNF81	P51508	661 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CDH15	P55291	814 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ACSM1	Q08AH1	577 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	DHRS3	O75911	302 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	RAF1	P04049	648 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	SOD3	P08294	240 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	ACHE	P22303	614 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	GPR50	Q13585	617 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	CDK5R1	Q15078	307 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	SMIM19	Q96E16	107 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	OR5M11	Q96RB7	305 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	MGLL	Q99685	303 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	DECR2	Q9NUI1	292 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-215	ENST00000569252	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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