RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565379.1

NME3-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 911 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-208ENST00000565379 MST1LQ2TV78 715 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 ZMAT1Q5H9K5 638 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 NANOGP1Q8N7R0 232 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 CCDC54Q8NEL0 328 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 TRIM36Q9NQ86 728 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 ERVK-18Q9QC07 812 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 CLEC2DQ9UHP7 191 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 SONP18583 2426 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 WNT4P56705 351 aa22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 TAS2R43P59537 309 aa22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 OR2G6Q5TZ20 316 aa22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 C11orf71Q6IPW1 123 aa22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 OR2G2Q8NGZ5 317 aa22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 MS4A5Q9H3V2 200 aa22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 TAAR3PQ9P1P4 343 aa22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 ZNF319Q9P2F9 582 aa22.16■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 PLSCR5A0PG75 271 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 IQCF6A8MYZ5 107 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 M0R233 179 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 CLPTM1O96005 669 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 TTRP02766 147 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 PSMB10P40306 273 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 PPOXP50336 477 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 TNK1Q13470 666 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 IRF3Q14653 427 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 NKPD1Q17RQ9 610 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 KCTD21Q4G0X4 260 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 LRP11Q86VZ4 500 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 OR2AE1Q8NHA4 323 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 CCDC90BQ9GZT6 254 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-208ENST00000565379 HIVEP2P31629 2446 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 GGT3PA6NGU5 568 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 IGLV3-1P01715 115 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 IGHV4-39P01824 125 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 FAM3AP98173 230 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 WDR38Q5JTN6 314 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 FTMTQ8N4E7 242 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 ZNF485Q8NCK3 441 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 GATAD2BQ8WXI9 593 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 DYNLRB1Q9NP97 96 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 C5orf63A6NC05 138 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 ZNF12P17014 697 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 CHN2P52757 468 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 BDH1Q02338 343 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 GFOD2Q3B7J2 385 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 TMEM244Q5VVB8 128 aa22.13■■□□□ 1.13
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NME3-208ENST00000565379 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 SLC22A4Q9H015 551 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 FRRS1LQ9P0K9 344 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 TMEM212A6NML5 194 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 DHRS7CA6NNS2 312 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 CD300LBA8K4G0 201 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 H7C417 338 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 TNFAIP8O95379 198 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 MT-ND2P03891 347 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 ISG15P05161 165 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 ANOS1P23352 680 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 MMP15P51511 669 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 ACSM1Q08AH1 577 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 OR8B8Q15620 311 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 OR2T2Q6IF00 324 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 DOK3Q7L591 496 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 KLBQ86Z14 1044 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 PRSS35Q8N3Z0 413 aa22.12■■□□□ 1.13
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NME3-208ENST00000565379 DIRC2Q96SL1 478 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 COMMD4Q9H0A8 199 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 GPR84Q9NQS5 396 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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NME3-208ENST00000565379 CCL1P22362 96 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 MAP2K3P46734 347 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 GSK3AP49840 483 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 SPHARQ15513 63 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 CLEC12BQ2HXU8 276 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 ZBTB37Q5TC79 503 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 Q6ZSR3 168 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 PLPP7Q8NBV4 271 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 LYZL4Q96KX0 146 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-208ENST00000565379 CACNG6Q9BXT2 260 aa22.11■■□□□ 1.13
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