RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	AP3D1	O14617	1153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SYNGR1	O43759	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SEC22B	O75396	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	IGF2	P01344	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	STOM	P27105	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SAA4	P35542	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RGS6	P49758	472 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	UBE2E1	P51965	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FUT6	P51993	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MAPK14	Q16539	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	DPY30	Q9C005	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PRD5	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PRF3	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PRM7	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC28A1	O00337	649 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	NPIPB7	O75200	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CRCP	O75575	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SUPT7L	O94864	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC6A1	P30531	599 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MYCNOS	P40205	109 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FOXA1	P55317	472 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PKNOX1	P55347	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	IL5RA	Q01344	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	EPS8	Q12929	822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	BNIP2	Q12982	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PSG7	Q13046	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CCT7	Q99832	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CLDN24	A6NM45	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686		E7ESA3	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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