RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 FGF2P09038 288 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 RAC3P60763 192 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 C3orf49Q96BT1 292 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 ETHE1O95571 254 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 CA11O75493 328 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 ACKR3P25106 362 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 FCN2Q15485 313 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 OR10K2Q6IF99 312 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 K7EQS6 105 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 OR5H8P0DN80 308 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 ALOX5APP20292 161 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 HCCSP53701 268 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 OR10J4P0C629 311 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 OR5AS1Q8N127 324 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 MED30Q96HR3 178 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 RAB40CQ96S21 281 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 COPS3Q9UNS2 423 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 LRP12Q9Y561 859 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 PLPP3O14495 311 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 EPXP11678 715 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB25P24278 435 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
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