RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	GPR50	Q13585	617 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF649	Q9BS31	505 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM100	Q9NV29	134 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730		A0A087WXM4	84 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	PRR32	B1ATL7	298 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	GMDS	O60547	372 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	TTR	P02766	147 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	CD2	P06729	351 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ACHE	P22303	614 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF81	P51508	661 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ART1	P52961	327 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	CDH15	P55291	814 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	IRF3	Q14653	427 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MED22	Q15528	200 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	OR8B8	Q15620	311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	TRAM1	Q15629	374 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	NRGN	Q92686	78 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	SMIM19	Q96E16	107 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	OGG1	O15527	345 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	PNP	P00491	289 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ADH4	P08319	380 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	CCL1	P22362	96 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	GSK3A	P49840	483 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ERVS71-1	P61550	626 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	FAM3A	P98173	230 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	CDK5R1	Q15078	307 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	WDR38	Q5JTN6	314 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	UFD1	Q92890	307 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	DECR2	Q9NUI1	292 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1W2PPR1	153 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	C17orf100	A8MU93	164 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	IFNL4	K9M1U5	179 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	CST4	P01036	141 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	IGLV3-1	P01715	115 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MT-ND2	P03891	347 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	SOD3	P08294	240 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	PAX1	P15863	534 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	TNFRSF1A	P19438	455 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MPV17	P39210	176 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	PSMB10	P40306	273 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730		Q6ZSR3	168 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	GPR148	Q8TDV2	347 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-224	ENST00000534730	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.06	□□□□□ -0.32

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