RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	FAM206A	Q9NX38	181 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	DAPL1	A0PJW8	107 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	GRP	P07492	148 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	IL2RG	P31785	369 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	CD200	P41217	278 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	BTG1	P62324	171 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	OCLN	Q16625	522 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	KLB	Q86Z14	1044 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SPIC	Q8N5J4	248 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ERGIC1	Q969X5	290 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	GCM1	Q9NP62	436 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ABCB9	Q9NP78	766 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	GNG8	Q9UK08	70 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059		R4GMQ9	66 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	METTL15	A6NJ78	407 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PRR32	B1ATL7	298 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059		B4DSR2	109 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	LMX1B	O60663	402 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	HNF1A	P20823	631 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MAP2K3	P46734	347 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SSX6	Q7RTT6	188 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MICU1	Q9BPX6	476 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	CR1	P17927	2039 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059		A0A0U1RQV5	110 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM178B	H3BS89	294 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	WNT9B	O14905	357 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SLC16A6	O15403	523 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PCMT1	P22061	227 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ACTA2	P62736	377 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ACTG2	P63267	376 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF91	Q05481	1191 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	OR8B8	Q15620	311 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	OR51F2	Q8NH61	342 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PIGC	Q92535	297 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SOX7	Q9BT81	388 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	GPR84	Q9NQS5	396 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	AASS	Q9UDR5	926 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1B0GVI7	797 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1B0GWJ7	208 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	FAM20B	O75063	409 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SULT1C4	O75897	302 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	IGHV2-5	P01817	119 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MSMB	P08118	114 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	GATA4	P43694	442 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54

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