RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 GABARAPL3Q9BY60 117 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 UFSP2Q9NUQ7 469 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 PPIAL4AQ9Y536 164 aa22.12■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 CEACAM18A8MTB9 384 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF205O95201 554 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 IL4I1Q96RQ9 567 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 C14orf119Q9NWQ9 140 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 H3BNX3 289 aa22.1■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 DCTDP32321 178 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 OR8B8Q15620 311 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF404Q494X3 552 aa22.09■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 FAM201AQ5SY85 155 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF679Q8IYX0 411 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 FTMTQ8N4E7 242 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 OR8S1Q8NH09 359 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 OR8B4Q96RC9 309 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM246Q9BRR3 403 aa22.09■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 A8MXK9 166 aa22.08■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 OR8B12Q8NGG6 310 aa22.08■■□□□ 1.13
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TSPAN4-217ENST00000527644 C7orf69Q9H7B7 122 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 C1orf123Q9NWV4 160 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM206AQ9NX38 181 aa22.07■■□□□ 1.12
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TSPAN4-217ENST00000527644 LOC105371242A0A075B767 164 aa22.06■■□□□ 1.12
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TSPAN4-217ENST00000527644 ALPLP05186 524 aa22.06■■□□□ 1.12
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TSPAN4-217ENST00000527644 OR8J1Q8NGP2 316 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 ITFG2Q969R8 447 aa22.06■■□□□ 1.12
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TSPAN4-217ENST00000527644 LYZL4Q96KX0 146 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 CLN6Q9NWW5 311 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 USE1Q9NZ43 259 aa22.06■■□□□ 1.12
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TSPAN4-217ENST00000527644 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 A6NLC8 198 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 PRR32B1ATL7 298 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 CXCR4P61073 352 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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TSPAN4-217ENST00000527644 NLRC3Q7RTR2 1065 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 ABCB9Q9NP78 766 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 MMP26Q9NRE1 261 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 MPC1Q9Y5U8 109 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A0U1RQV5 110 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-217ENST00000527644 TRAPPC2LH3BP13 241 aa22.04■■□□□ 1.12
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