RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 CADM3Q8N126 398 aa20.2■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa20.2■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 PHF21AQ96BD5 680 aa20.2■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 XRCC2O43543 280 aa20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 PRF1P14222 555 aa20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 ACKR3P25106 362 aa20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 STOMP27105 288 aa20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 28.8
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ACER3-204ENST00000525861 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 OR6K3Q8NGY3 331 aa20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 SPACA5Q96QH8 159 aa20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 ATG5Q9H1Y0 275 aa20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 KDM4BO94953 1096 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 EDN3P14138 238 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 RAB6AP20340 208 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 RANBP1P43487 201 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 KIR2DL3P43628 341 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 PLP2Q04941 152 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 TBRG1Q3YBR2 411 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 EXTL1Q92935 676 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 SRP9P49458 86 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 TGFBR3Q03167 851 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 UBE2V2Q15819 145 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 AWAT2Q6E213 333 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 MTFR2Q6P444 385 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 Q6ZT83 130 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 RNF144BQ7Z419 303 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 OR52I2Q8NH67 350 aa20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 C5orf49A4QMS7 147 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 FAM157BP0CG42 384 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 IGHV1-2P23083 117 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 GDNFP39905 211 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 TNK1Q13470 666 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 GPR176Q14439 515 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 GSG1Q2KHT4 349 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 OR10K2Q6IF99 312 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 ANGPTL5Q86XS5 388 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 DUSP18Q8NEJ0 188 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 FCAMRQ8WWV6 532 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 SPSB4Q96A44 273 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 RAB22AQ9UL26 194 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 CACNG2Q9Y698 323 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 QRFPP83859 136 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 ZNF92Q03936 586 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 KRTCAP3Q53RY4 240 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 VWA1Q6PCB0 445 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 ITPKCQ96DU7 683 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 MMP28Q9H239 520 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa20.17■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 A0A0A6YYH2 397 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 A6NJ64 397 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 ORC5O43913 435 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 PTHLHP12272 177 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 CCNOP22674 350 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 FAM3AP98173 230 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 PMPCAQ10713 525 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 PPP1R14BQ96C90 147 aa20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 VSIG8P0DPA2 414 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 CCL2P13500 99 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 GSK3AP49840 483 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 TMPRSS3P57727 454 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 UNC119Q13432 240 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 OR8B8Q15620 311 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 KISS1Q15726 138 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 GPER1Q99527 375 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 TRAV18A0A075B6X5 111 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 WDR1O75083 606 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 OR3A4PP47883 348 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 FOXF2Q12947 444 aa20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 MYO7BQ6PIF6 2116 aa20.14■□□□□ 0.82
ACER3-204ENST00000525861 TPOP07202 933 aa20.14■□□□□ 0.81
ACER3-204ENST00000525861 SLC6A1P30531 599 aa20.14■□□□□ 0.81
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