RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINE2P07093 398 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB5AP20339 215 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 KITLGP21583 273 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CRHBPP24387 322 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ELK3P41970 407 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 AGTR2P50052 363 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PPOXP50336 477 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PDX1P52945 283 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 S100A10P60903 97 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TBPL1P62380 186 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE7AQ13946 482 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 BPIFB2Q8N4F0 458 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR148Q8TDV2 347 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC35E1Q96K37 410 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2M2Q96R28 347 aa4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 NDC1Q9BTX1 674 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 MED28Q9H204 178 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 Q9N2K0 584 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 FGF21Q9NSA1 209 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 RAP2CQ9Y3L5 183 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 C5orf42Q9H799 3197 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 MUC3AQ02505 3323 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SMCO3A2RU48 225 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 DVL1O14640 695 aa4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 PCDH7O60245 1069 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 VENTXO95231 258 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 LCN2P80188 198 aa4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC75AQ8NAA5 344 aa4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CLCC1Q96S66 551 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 LYSMD1Q96S90 227 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 GINS4Q9BRT9 223 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 RNF6Q9Y252 685 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PRORSD1PA6NEY8 169 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 DSCR3O14972 297 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TYROBPO43914 113 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PROSCO94903 275 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB36O95755 333 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 HPRT1P00492 218 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPIND1P05546 499 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OR13C7P0DN81 318 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CD79AP11912 226 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 FABP4P15090 132 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 GPX2P18283 190 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 FPR2P25090 351 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 MST1P26927 711 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP16P51512 607 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 BIDP55957 195 aa4.05□□□□□ -1.76
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