RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 ATP6V1B1P15313 513 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF823P16415 610 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 NPR2P20594 1047 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 COX5AP20674 150 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 MSR1P21757 451 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 DCKP27707 260 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 MPGP29372 298 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 OPRM1P35372 400 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 CD79BP40259 229 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 MAP2K4P45985 399 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ATRXP46100 2492 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ETV1P50549 477 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ARF1P84077 181 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ADORA2A-AS1P86434 159 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF85Q03923 595 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 IRF3Q14653 427 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 TSC22D1Q15714 1073 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 STK11Q15831 433 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 PCK2Q16822 640 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 OR2G6Q5TZ20 316 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 FAM27BQ5VT28 67 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 TMEM154Q6P9G4 183 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF773Q6PK81 442 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 CORO6Q6QEF8 472 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC22A25Q6T423 547 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 Q6ZT83 130 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 PRSS48Q7RTY5 328 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 DCXRQ7Z4W1 244 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 LHFPL3Q86UP9 236 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 SKA3Q8IX90 412 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 GABRG1Q8N1C3 465 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ACBD7Q8N6N7 88 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 OR10S1Q8NGN2 331 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 OR1K1Q8NGR3 316 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 OTOSQ8NHW6 89 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 RND1Q92730 232 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 FBXO17Q96EF6 278 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 AMELYQ99218 206 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 SH3GL3Q99963 347 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF416Q9BWM5 594 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 CDCA4Q9BXL8 241 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 YIPF3Q9GZM5 350 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 CLEC2DQ9UHP7 191 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 LAMP5Q9UJQ1 280 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 POLR1DQ9Y2S0 133 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ATMQ13315 3056 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 USP24Q9UPU5 2620 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 A0A087WXM4 84 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 A0A1W2PR80 420 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 DAPL1A0PJW8 107 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 CXorf65A6NEN9 183 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 RER1O15258 196 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 LRRTM2O43300 516 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 PTHP01270 115 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 CST2P09228 141 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 OR2T7P0C7T2 308 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 OR8G3PP0DMU2 310 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF32P17041 273 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 MYL12AP19105 171 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ALOX5APP20292 161 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 PCMT1P22061 227 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 OR12D2P58182 307 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 LSM6P62312 80 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ACTC1P68032 377 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 ACTA1P68133 377 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 TUBA1BP68363 451 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 AQP6Q13520 282 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 NEDD8Q15843 81 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 GABRA6Q16445 453 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 CDONQ4KMG0 1287 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 TP53I3Q53FA7 332 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 HIKESHIQ53FT3 197 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPVD1-218ENST00000495588 TEX30Q5JUR7 227 aa4.75□□□□□ -1.65
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