RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TBX1	O43435	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	SOX14	O95416	240 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	KNG1	P01042	644 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	OMG	P23515	440 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	HSD11B1	P28845	292 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	GRK5	P34947	590 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	RAG2	P55895	527 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	REEP1	Q9H902	201 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	DVL1	O14640	695 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TIPRL	O75663	272 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	LHB	P01229	141 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	APOC1	P02654	83 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	MELTF	P08582	738 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	CLU	P10909	449 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	MICB	Q29980	383 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	MICA	Q29983	383 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	SIRPD	Q9H106	197 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	CMC2	Q9NRP2	79 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601		U3KQV3	271 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	KCNAB3	O43448	404 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	NDUFA7	O95182	113 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	IGHV1-69	P01742	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	GNGT1	P63211	74 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM3A	P98173	230 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	SNCB	Q16143	134 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	DHFR2	Q86XF0	187 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	GNAL	P38405	381 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	LHX4	Q969G2	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	KPTN	Q9Y664	436 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A1B0GVI7	797 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	FCN3	O75636	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	GSTT1	P30711	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-208	ENST00000493601	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms