RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 C12orf77C9JDV5 145 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CLDN11O75508 207 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 TNFP01375 233 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 DBTP11182 482 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CTSEP14091 401 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CD99P14209 185 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ABOP16442 354 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CRISP2P16562 243 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ACTR1BP42025 376 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CSNK1DP48730 415 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CCR6P51684 374 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ACTR1AP61163 376 aa2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 REG3AQ06141 175 aa2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0087Q14695 138 aa2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 ARMC12Q5T9G4 340 aa2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 FBXL13Q8NEE6 735 aa2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 OR51G1Q8NGK1 321 aa2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF606Q8WXB4 792 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM159Q96B96 161 aa2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 SLC41A3Q96GZ6 507 aa2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM246Q9BRR3 403 aa2.06□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 GON7Q9BXV9 100 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ULBP3Q9BZM4 244 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB127Q9H1M4 99 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 SRMSQ9H3Y6 488 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC19Q9H756 370 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ETNK2Q9NVF9 386 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 DDIT4Q9NX09 232 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 GIN1Q9NXP7 522 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAPPC4Q9Y296 219 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A15Q9Y619 301 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC13O75165 2243 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GVL5 298 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 NKX2-6A6NCS4 301 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5B21A6NL26 309 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 KDELR3O43731 214 aa2.05□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 APOEP02649 317 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 PAEPP09466 180 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF32P17041 273 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 NELFEP18615 380 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 SYT1P21579 422 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CMA1P23946 247 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CA7P43166 264 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 SULT1E1P49888 294 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CRISP3P54108 245 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 AIF1P55008 147 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF235Q14590 738 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 FILIP1LQ4L180 1135 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM92BQ6ZTR7 304 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
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RABGGTB-211ENST00000489450 FAM184AQ8NB25 1140 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 MARCH1Q8TCQ1 289 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 CXorf40AQ8TE69 158 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PIH1D2Q8WWB5 315 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM62Q9BVG3 475 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 UCK2Q9BZX2 261 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 MCCC2Q9HCC0 563 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM60AQ9NP50 221 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 KLK12Q9UKR0 248 aa2.05□□□□□ -2.08
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