RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 CCNOP22674 350 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNJ1P48048 391 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 AMTP48728 403 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 IDH2P48735 452 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 ENTPD1P49961 510 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 UBE2E1P51965 193 aa3.16□□□□□ -1.9
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ECHDC1-211ENST00000460558 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
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ECHDC1-211ENST00000460558 SELPLGQ14242 412 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
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ECHDC1-211ENST00000460558 CHI3L2Q15782 390 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 C6orf136Q5SQH8 315 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.16□□□□□ -1.9
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ECHDC1-211ENST00000460558 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 BTN2A1Q7KYR7 527 aa3.16□□□□□ -1.9
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ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM123Q8N131 208 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 OR52H1Q8NGJ2 320 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 CORO2AQ92828 525 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 LRR1Q96L50 414 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2M2Q96R28 347 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa3.16□□□□□ -1.9
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 DVL1O14640 695 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 CH25HO95992 272 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 TOMM40O96008 361 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT14P02533 472 aa3.15□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 CXCR1P25024 350 aa3.15□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 MEP1BQ16820 701 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.15□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM201AQ5SY85 155 aa3.15□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 EMBQ6PCB8 327 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ARL9Q6T311 187 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.15□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.15□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 OCC1Q8TAD7 63 aa3.15□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 SETD6Q8TBK2 473 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP36Q96G28 342 aa3.15□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 OXGR1Q96P68 337 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.15□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 CTSZQ9UBR2 303 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 TCF19Q9Y242 345 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 AGRNO00468 2067 aa3.15□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0B4J293 547 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 C5orf49A4QMS7 147 aa3.14□□□□□ -1.91
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