RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HRH1P35367 487 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PER3P56645 1201 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CXADRP78310 365 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBE2V2Q15819 145 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C10orf128Q5T292 105 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF529Q6P280 563 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPR137Q96N19 417 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LPAR5Q9H1C0 372 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MOB1AQ9H8S9 216 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPTNQ9Y639 398 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM82A0PJX8 343 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBE2QL1A1L167 161 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHEP01854 428 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PMP2P02689 132 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF735P0CB33 412 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GRK1Q15835 563 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLAC9Q5JTB6 97 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DOK3Q7L591 496 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AAED1Q7RTV5 226 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NTNG2Q96CW9 530 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPTBN2O15020 2390 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF716A6NP11 495 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BPNT1O95861 308 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SERPINA2P20848 420 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF84P51523 738 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C3AR1Q16581 482 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TEX261Q6UWH6 196 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR10R2Q8NGX6 335 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 U3KQ87 197 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SVILO95425 2214 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCSO14618 274 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARPC5O15511 151 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SSX5O60225 188 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NEURL1O76050 574 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ITGB2P05107 769 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IL5P05113 134 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR4E1P0C645 316 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FOXO1Q12778 655 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KISS1Q15726 138 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDH24Q86UP0 819 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2AK2Q8NG84 335 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPRY4Q9C004 299 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IFT46Q9NQC8 304 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPR173Q9NS66 373 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GJE1A6NN92 205 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDC14BO60729 498 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RAD51DO75771 328 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MT-CO3P00414 261 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FCGR2AP12318 317 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CPN1P15169 458 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF32P17041 273 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CXCL2P19875 107 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RAB6AP20340 208 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM50BP56557 158 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POU4F3Q15319 338 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TGIF1Q15583 401 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2V1Q8NHB1 315 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VSIG4Q9Y279 399 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SGCEO43556 437 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RGS11O94810 467 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TPPPO94811 219 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNFSF15O95150 251 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TPOP07202 933 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACKR3P25106 362 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAGEA5P43359 124 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HES3Q5TGS1 186 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CRIP3Q6Q6R5 217 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BATF2Q8N1L9 274 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms