RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 C17orf99Q6UX52 265 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NRMQ8IXM6 262 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 AMER3Q8N944 861 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RAB8BQ92930 207 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CD180Q99467 661 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ARV1Q9H2C2 271 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZMAT4Q9H898 229 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CD84Q9UIB8 345 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 VSIG4Q9Y279 399 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PTPRDP23468 1912 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TSPAN11A1L157 253 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RAMP1O60894 148 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 EPPINO95925 133 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IGSF6O95976 241 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HPRT1P00492 218 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IFNA21P01568 189 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PGA4P0DJD7 388 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PGA5P0DJD9 388 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LIPCP11150 499 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GJA4P35212 333 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ARF6P62330 175 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 UBE2V1Q13404 147 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GGTLC2Q14390 218 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FBXL22Q6P050 247 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LEG1Q6P5S2 330 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM186Q96B77 213 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLC35E1Q96K37 410 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLC35G5Q96KT7 338 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PRAP1Q96NZ9 151 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TP53RKQ96S44 253 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MED20Q9H944 212 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IL36AQ9UHA7 158 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 A8MVM7 634 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CLDN34H7C241 214 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PEX12O00623 359 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 KCNAB3O43448 404 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LGALS2P05162 132 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CRYGCP07315 174 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CHRM2P08172 466 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM225BP0DP42 221 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TDGF1P13385 188 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FOSL2P15408 326 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SELEP16581 610 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TACR2P21452 398 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ECI1P42126 302 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FASLGP48023 281 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HSF1Q00613 529 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 REEP5Q00765 189 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 DUSP8Q13202 625 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 C1orf189Q5VU69 101 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GRINAQ7Z429 371 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SMIM12Q96EX1 92 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 VPS25Q9BRG1 176 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.2 ms