RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 GNG8Q9UK08 70 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TANC2Q9HCD6 1990 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A0U1RQV5 110 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 OR8B8Q15620 311 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 BIVMQ86UB2 503 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 COMMD2Q86X83 199 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 OR51E1Q8TCB6 317 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ACOXLQ9NUZ1 547 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 DCAF16Q9NXF7 216 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 OR52A1Q9UKL2 312 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 DYSFO75923 2080 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 MTORP42345 2549 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 CSPG4Q6UVK1 2322 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 LRP5LA4QPB2 252 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP6V1G2O95670 118 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 FADS2O95864 444 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TTRP02766 147 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ACKR3P25106 362 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SRP9P49458 86 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB40BQ12829 278 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 OR52I1Q8NGK6 324 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RORBQ92753 470 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TFAP2CQ92754 450 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC22A4Q9H015 551 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR84Q9NQS5 396 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC22A13Q9Y226 551 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 LY6G6DO95868 133 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 MAB21L1Q13394 359 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RIPK1Q13546 671 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 CDONQ4KMG0 1287 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 AVPI1Q5T686 147 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 LHFPL3Q86UP9 236 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 NARFLQ9H6Q4 476 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 GCM1Q9NP62 436 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 TLN2Q9Y4G6 2542 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 CLDN25C9JDP6 229 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 GMDSO60547 372 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM20BO75063 409 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 IGHA1P01876 353 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 PSMB10P40306 273 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 OR12D2P58182 307 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 MVKQ03426 396 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 CLEC9AQ6UXN8 241 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 Q71RC1 249 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-202ENST00000410062 WNT9BO14905 357 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 IGLV3-1P01715 115 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 TACSTD2P09758 323 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 CD200P41217 278 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 ODF4Q2M2E3 257 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM249Q2WGJ8 235 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 KLHL22Q53GT1 634 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 CATSPERDQ86XM0 798 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 ALG8Q9BVK2 526 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM106BQ9NUM4 274 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 H0YJX3 145 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 J3QLW9 94 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF19P17023 458 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 KRTAP1-1Q07627 177 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 MOGAT3Q86VF5 341 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 VCX3BQ9H321 246 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 ERVK13-1Q9NX77 482 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 WIPI2Q9Y4P8 454 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 ABCA1O95477 2261 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 P2RY10O00398 339 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 IL2RGP31785 369 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 CHN2P52757 468 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 GALEQ14376 348 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 PRSS35Q8N3Z0 413 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 C4orf36Q96KX1 117 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF649Q9BS31 505 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 GNALP38405 381 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 MAP2K3P46734 347 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 ACTA2P62736 377 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-202ENST00000410062 ACTG2P63267 376 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms