RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 TBX1O43435 398 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ICMTO60725 284 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TNFSF13O75888 250 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SCGNO76038 276 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 WISP2O76076 250 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LCATP04180 440 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CD79AP11912 226 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 EDN3P14138 238 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 PRF1P14222 555 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ELK1P19419 428 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV1-2P23083 117 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 STOMP27105 288 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 HTR2CP28335 458 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 APLNRP35414 380 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ART1P52961 327 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SCN1BQ07699 218 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 KLRB1Q12918 225 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 MALLQ13021 153 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 GABRA6Q16445 453 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 RTL6Q6ICC9 239 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 COMMD2Q86X83 199 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SGK3Q96BR1 496 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 HAVCR1Q96D42 359 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 STARD4Q96DR4 205 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 F8P00451 2351 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 A0A096LPE4 126 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PPZ6 126 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CIB4A0PJX0 185 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 AGFG2O95081 481 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 PAHP00439 452 aa8.51□□□□□ -1.05
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POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DQB1P01920 261 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 DBHP09172 617 aa8.51□□□□□ -1.05
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POLR1A-202ENST00000409024 SLC2A1P11166 492 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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POLR1A-202ENST00000409024 RAB6AP20340 208 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 PRKACBP22694 351 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 HOXC12P31275 282 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OPRM1P35372 400 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 MMP15P51511 669 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 IL18Q14116 193 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF79Q15937 498 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 PYDC2Q56P42 97 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 HES5Q5TA89 166 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM42Q69YG0 159 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 GFRALQ6UXV0 394 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 NAA40Q86UY6 237 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CD163Q86VB7 1156 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SPSB1Q96BD6 273 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ORAI1Q96D31 301 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 REEP6Q96HR9 211 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LYZL4Q96KX0 146 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF75AQ96N20 296 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CHST5Q9GZS9 411 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OR10A4Q9H209 315 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJC13O75165 2243 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.5□□□□□ -1.05
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