RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 HLA-DPB1P04440 258 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 WNT2P09544 360 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC2A1P11166 492 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PSKH1P11801 424 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GNALP38405 381 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MAP2K3P46734 347 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GSK3AP49840 483 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CDC42P60953 191 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM3AP98173 230 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 IL5RAQ01344 420 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MAB21L1Q13394 359 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8B8Q15620 311 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8S1Q8NH09 359 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CIB1Q99828 191 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.15□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM210A6NLX4 147 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 LGALS8O00214 317 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 CST4P01036 141 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 CFHR2P36980 270 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 NPY4RP50391 375 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 EGR3Q06889 387 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF404Q494X3 552 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 KRT74Q7RTS7 529 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 NANPQ8TBE9 248 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8B4Q96RC9 309 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8B2Q96RD0 313 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 AMELYQ99218 206 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 MICU1Q9BPX6 476 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 CLN6Q9NWW5 311 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 USE1Q9NZ43 259 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 LRP12Q9Y561 859 aa7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC182A6NF36 153 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF212BA8MTL3 300 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 TCF21O43680 179 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM20BO75063 409 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 SULT1C4O75897 302 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 ALPLP05186 524 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2T7P0C7T2 308 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 FPR2P25090 351 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 EPHA2P29317 976 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 HTR1FP30939 366 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6V1E1P36543 226 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 PMELP40967 661 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 ALDH3A2P51648 485 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 CD276Q5ZPR3 534 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 USP43Q70EL4 1123 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.13□□□□□ -1.27
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.13□□□□□ -1.27
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