RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384299.1

RNU6-472P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 472, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-472P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-472P-201ENST00000384299 SSR4P51571 173 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 IFITM3Q01628 133 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 USH1GQ495M9 461 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 PDZK1Q5T2W1 519 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 RPRMLQ8N4K4 120 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 ANKFN1Q8N957 763 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 OR4M2Q8NGB6 313 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 OR51F2Q8NH61 342 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 RXFP4Q8TDU9 374 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 YIPF6Q96EC8 236 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 SLC41A3Q96GZ6 507 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 FMO2Q99518 471 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 COPS8Q99627 209 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 B9D2Q9BPU9 175 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 PIGLQ9Y2B2 252 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 LCTP09848 1927 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 A0A087WZY1 265 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 SYCE1LA8MT33 242 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 PDZK1P1A8MUH7 402 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 F5H5T6 163 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 TGM6O95932 706 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 BMI1P35226 326 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 RABIFP47224 123 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 RGS6P49758 472 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 RGS4P49798 205 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 PPT1P50897 306 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 GMFBP60983 142 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 PPP1CAP62136 330 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 HOXC5Q00444 222 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 TPRXLQ17RH7 258 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 FAM201AQ5SY85 155 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 TTC23Q5W5X9 447 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 NOXRED1Q6NXP6 359 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 DRAM1Q8N682 238 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 NKAIN3Q8N8D7 197 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 CDS1Q92903 461 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 IFT74Q96LB3 600 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 MTMR9Q96QG7 549 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 OR5B12Q96R08 314 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 PITX2Q99697 317 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 GPA33Q99795 319 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 TIMM21Q9BVV7 248 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 SLC19A3Q9BZV2 496 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 AICDAQ9GZX7 198 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 PORCNQ9H237 461 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 CA10Q9NS85 328 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 HES2Q9Y543 173 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 CACNA1BQ00975 2339 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 MROH5Q6ZUA9 1318 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-472P-201ENST00000384299 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 XKRY2A2RUG3 117 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 BTBD17A6NE02 478 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 C17orf98A8MV24 154 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 ODF3BA8MYP8 253 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 KLHL41O60662 606 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 ARG1P05089 322 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 KITLGP21583 273 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 GRIA1P42261 906 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 LIPEQ05469 1076 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 NAB1Q13506 487 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 CYHR1Q6ZMK1 362 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 HS3ST5Q8IZT8 346 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 CBR4Q8N4T8 237 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 KCNG3Q8TAE7 436 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 DCAKDQ8WVC6 231 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 FAM111AQ96PZ2 611 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 KCNK16Q96T55 309 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 TRIM62Q9BVG3 475 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 KRT23Q9C075 422 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 TOLLIPQ9H0E2 274 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 ETS2P15036 469 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 RPA2P15927 270 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-472P-201ENST00000384299 NCK1P16333 377 aa-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.8 ms