RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM256Q8N2U0 113 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIML2Q8N7C3 387 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 OR11H7Q8NGC8 314 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5T3Q8NGG3 340 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 OR9A2Q8NGT5 310 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 OR13G1Q8NGZ3 307 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 LYPD6BQ8NI32 183 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NDNFQ8TB73 568 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 APH1BQ8WW43 257 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CERS2Q96G23 380 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 RBBP8Q99708 897 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 TBL1YQ9BQ87 522 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ACBD6Q9BR61 282 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 GGTLC1Q9BX51 225 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf198Q9H425 327 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SPACA1Q9HBV2 294 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 UBAP1Q9NZ09 502 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 PTTG3PQ9NZH4 202 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ENOPH1Q9UHY7 261 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV6A0A075B6T7 132 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0J9YXV3 536 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB5O15062 677 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CHST10O43529 356 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 MYL2P10916 166 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CCL2P13500 99 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 IL1RNP18510 177 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 LOXP28300 417 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1E1P30953 314 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM34P42696 430 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ3P48549 501 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL23P62829 140 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 DGCR6Q14129 220 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ADNP2Q6IQ32 1131 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC23LQ6PF05 361 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf54Q6X4T0 127 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 COPS6Q7L5N1 327 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 NKAIN4Q8IVV8 208 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 SYCE1Q8N0S2 351 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00469Q8N7U9 141 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNS3Q9BQ31 491 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 RETNQ9HD89 108 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 TREM1Q9NP99 234 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 PXMP2Q9NR77 195 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 AK9Q5TCS8 1911 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 FHOD3Q2V2M9 1422 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PRD5 423 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 PDZK1P1A8MUH7 402 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 KRBOX1C9JBD0 128 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 H7C1H1 209 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 LGALS9O00182 355 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 FCN3O75636 299 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CBR3O75828 277 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV3-25P01717 112 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-HP01893 362 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 BCKDHBP21953 392 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ME2P23368 584 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 LCN1P31025 176 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CFHR2P36980 270 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFSF9P41273 254 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF266Q14584 549 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 NCF4Q15080 339 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 VAMP3Q15836 100 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 PSG3Q16557 428 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ERICH5Q6P6B1 374 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM122BQ7Z309 247 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CD302Q8IX05 232 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM71AQ8IYT1 594 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CMTM8Q8IZV2 173 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CBR4Q8N4T8 237 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 JAGN1Q8N5M9 183 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC75AQ8NAA5 344 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 TTLQ8NG68 377 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 OR51L1Q8NGJ5 315 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4A15Q8NGL6 344 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52E5Q8NH55 327 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CLHC1Q8NHS4 586 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ASZ1Q8WWH4 475 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNG8Q8WXS5 425 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL5BQ96KC2 179 aa1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms