RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 GHRLQ9UBU3 117 aa16.79■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNE3Q9Y6H6 103 aa16.79■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2J2O76002 312 aa16.79■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 LY86O95711 162 aa16.79■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 RLN3Q8WXF3 142 aa16.79■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 LAT2Q9GZY6 243 aa16.79■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SLX4Q8IY92 1834 aa16.79■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 EVPLQ92817 2033 aa16.79■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 AQP7P3A6NL99 342 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 K7EQM0 130 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 ARG1P05089 322 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 CRYBA1P05813 215 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 PXNP49023 591 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 PMS2P11Q13670 270 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 RTL10Q7L3V2 364 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 UBE3DQ7Z6J8 389 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SCRG1O75711 98 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 EDDM3BP56851 147 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2B11Q5JQS5 317 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 TRILQ7L0X0 811 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 RDH5Q92781 318 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 OR8B4Q96RC9 309 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 MED29Q9NX70 200 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SP6Q3SY56 376 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 AWAT1Q58HT5 328 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 OR52N4Q8NGI2 321 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF426Q9BUY5 554 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 CALHM2Q9HA72 323 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 B3GAT1Q9P2W7 334 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 HPXP02790 462 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 PMCHP20382 165 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCD3P28288 659 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 S100A7P31151 101 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SSR4P51571 173 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 TUSC1Q2TAM9 212 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 PRSS54Q6PEW0 395 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 FGF22Q9HCT0 170 aa16.78■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 CTAG2O75638 210 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 CD1CP29017 333 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 TNFRSF4P43489 277 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 ASCL1P50553 236 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 TAS2R45P59539 299 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 EDDM3AQ14507 147 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 POMT1Q9Y6A1 747 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A1W2PNV4 684 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 ENSAO43768 121 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF79Q15937 498 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM183BQ1AE95 376 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 FGF21Q9NSA1 209 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC31A2O15432 143 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SFT2D2O95562 160 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC25A6P12236 298 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNAB1Q14722 419 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 Q3ZCU0 254 aa16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
AMIGO1-202ENST00000369864 CDKN3Q16667 212 aa16.77■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CD300LDQ6UXZ3 194 aa16.77■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 NRASP01111 189 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC37A1P57057 533 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 DPTQ07507 201 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 C16orf52Q8NHV5 167 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 OTOSQ8NHW6 89 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 NXPE3Q969Y0 559 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 SEC11CQ9BY50 192 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ABLIM3O94929 683 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 WNT11O96014 354 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 PPICP45877 212 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 GSK3AP49840 483 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CORO2AQ92828 525 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 OPN4Q9UHM6 478 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 OR7C2O60412 319 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 GALR1P47211 349 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 TM4SF4P48230 202 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ETFDHQ16134 617 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 VWA2Q5GFL6 755 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM26DQ5JW98 314 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
AMIGO1-202ENST00000369864 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms