RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CTDSPLO15194 276 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DSC1Q08554 894 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MOB3CQ70IA8 216 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ISLRO14498 428 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ACRP10323 421 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 BMPR1AP36894 532 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DOLPP1Q86YN1 238 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 RSG1Q9BU20 258 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 BTAF1O14981 1849 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MED12Q93074 2177 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF320A2RRD8 509 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ABLIM3O94929 683 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 NXPH2O95156 264 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DRD1P21728 446 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 SPRYD7Q5W111 196 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 C10orf35Q96D05 121 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 HRO43593 1189 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 B4GALT3O60512 393 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2M3Q8NG83 312 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DEGS1O15121 323 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 Q6ZN92 141 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR51M1Q9H341 326 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LHX3Q9UBR4 397 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 NCOR1O75376 2440 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DRGXA6NNA5 263 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CLDN15P56746 228 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PARP14Q460N5 1801 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFB6O95139 128 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CRYBB2P43320 205 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CMTM4Q8IZR5 234 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LDB3O75112 727 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CST6Q15828 149 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PMCHL1Q16048 86 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 SYPL1Q16563 259 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX30Q5JUR7 227 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR1L1Q8NH94 360 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR1O75083 606 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CD46P15529 392 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF175Q8N4F7 328 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LRP3O75074 770 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5AC1P0C628 307 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 RHOBP62745 196 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LTC4SQ16873 150 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ADGRG7Q96K78 797 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 STC2O76061 302 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CRYBA1P05813 215 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A087WV62 115 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM123Q8N131 208 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CTSFQ9UBX1 484 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1W2PP55 124 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MBTPS2O43462 519 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 FABP2P12104 132 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms