RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 M0R1B8 84 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 CTSLP07711 333 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 CHRNA7P36544 502 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TCTAP57738 103 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 UBTD2Q8WUN7 234 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 PBOV1Q9GZY1 135 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 HMGN4O00479 90 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 OPN1MWP04001 364 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM157BP0CG42 384 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 OPN1MW2P0DN77 364 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 OPN1MW3P0DN78 364 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM209AQ5JX71 171 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 BTNL3Q6UXE8 466 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 EXD3Q8N9H8 876 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 OR2T6Q8NHC8 308 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM174AQ8TBP5 190 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 CMTM3Q96MX0 182 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 F5H697 171 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 M0R082 166 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TNFSF11O14788 317 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 EDN1P05305 212 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 GALNT16Q8N428 558 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC16A11Q8NCK7 471 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 PRDM7Q9NQW5 492 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF737O75373 536 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 GPANK1O95872 356 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 ICAM2P13598 275 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 GNG4P50150 75 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 CCSMST1Q4G0I0 132 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 MISP3Q96FF7 219 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 FXYD1O00168 92 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TBX19O60806 448 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 MT-ATP6P00846 226 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 HTR1DP28221 377 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 ABCD3P28288 659 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 AVPR2P30518 371 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 HGDQ93099 445 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM166BA8MTA8 275 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 MANEAQ5SRI9 462 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF24Q9Y225 148 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 IFITM5A6NNB3 132 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 EGR3Q06889 387 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 HTR3DQ70Z44 454 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 BCORP1Q8N888 145 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 DTD1Q8TEA8 209 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 POMT2Q9UKY4 750 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 M0R1X1 148 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 AP4M1O00189 453 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 ZXDAP98168 799 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 ST3GAL2Q16842 350 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 AFMIDQ63HM1 303 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM210BQ96KR6 192 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF2Q99496 336 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 IL21Q9HBE4 155 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 TBXA2RP21731 343 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 SULT1A1P50225 295 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 DHRS13Q6UX07 377 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 MOB3AQ96BX8 217 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 USP3Q9Y6I4 520 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 CTSAP10619 480 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 EMDP50402 254 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 SP6Q3SY56 376 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 EDEM2Q9BV94 578 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 NPTNQ9Y639 398 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 R4GMQ9 66 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C1-201ENST00000356183 ZAR1LA6NP61 321 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms