RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 VSTM2LQ96N03 204 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 RASL10BQ96S79 203 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FSCN3Q9NQT6 498 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0B4J203 849 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 DDOQ99489 341 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 EPPINO95925 133 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CCL4P13236 92 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZRG5 221 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 BTF3L4Q96K17 158 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf45Q96LM5 186 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 GLI4P10075 376 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 TGFBR1P36897 503 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6C68A6NDL8 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 HRH1P35367 487 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 RAC3P60763 192 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FUT3P21217 361 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 ORAI1Q96D31 301 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 PELI1Q96FA3 418 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CMTM3Q96MX0 182 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PPV9 198 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 TAAR5O14804 337 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FUCA1P04066 466 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 MCHR2Q969V1 340 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SSX4O60224 188 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2F2O95006 317 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 NXPH3O95157 252 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 EML2O95834 649 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 LALBAP00709 142 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 PSG6Q00889 435 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2F1Q13607 317 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR38Q5JTN6 314 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 PXT1Q8NFP0 134 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5H15A6NDH6 313 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 PLPP3O14495 311 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHA2P01877 340 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QBP02746 253 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV4-34P06331 123 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 LFNGQ8NES3 379 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CORO2AQ92828 525 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO17Q96EF6 278 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB27BO00194 218 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 GPNMBQ14956 572 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 DOK1Q99704 481 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 RER1O15258 196 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 PLPP2O43688 288 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF32P17041 273 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CD82P27701 267 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CHST6Q9GZX3 395 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CYR61O00622 381 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMB3P49720 205 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 DHRS3O75911 302 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 JTBO76095 146 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-DOBP13765 273 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 DHODHQ02127 395 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 TMUB2Q71RG4 321 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 HES7Q9BYE0 225 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms