RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 ETV7Q9Y603 341 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MEOX1P50221 254 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF727A8MUV8 499 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SRFP11831 508 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 GCAP28676 217 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CCDC190Q86UF4 302 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CMTM4Q8IZR5 234 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 GYPAP02724 150 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CEACAM6P40199 344 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 AGERQ15109 404 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SP6Q3SY56 376 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 KMT5CQ86Y97 462 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MT-ATP6P00846 226 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SDHAP31040 664 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CGB2Q6NT52 195 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TEAD3Q99594 435 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 WNT1P04628 370 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CD40P25942 277 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 BPIFB3P59826 476 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 IHHQ14623 411 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 AVPI1Q5T686 147 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SMIM12Q96EX1 92 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZPBPQ9BS86 351 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LYRM4Q9HD34 91 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DAPP1Q9UN19 280 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FABP4P15090 132 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PMCHP20382 165 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 S100A11P31949 105 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TCTN1Q2MV58 587 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 HFEQ30201 348 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ACSM5Q6NUN0 579 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LSMEM2Q8N112 164 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TOX2Q96NM4 488 aa9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 M0R1X1 148 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MT-ND4LP03901 98 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TAS2R45P59539 299 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 GUCA2AQ02747 115 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF787Q6DD87 383 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RPEQ96AT9 228 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 K7EQS6 105 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ARNTLO00327 626 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CST7O76096 145 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MTNR1BP49286 362 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DGCR2P98153 550 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 VAMP3Q15836 100 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLC39A13Q96H72 371 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OXGR1Q96P68 337 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DDOQ99489 341 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 COA4Q9NYJ1 87 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TMPRSS2O15393 492 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 AGFG2O95081 481 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ORM2P19652 201 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 HES3Q5TGS1 186 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CYS1Q717R9 158 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LRP11Q86VZ4 500 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CA13Q8N1Q1 262 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLC7A6Q92536 515 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MARC2Q969Z3 335 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.54□□□□□ -0.88
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