RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 GDE1Q9NZC3 331 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 FBXL17Q9UF56 701 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SCN5AQ14524 2016 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 AWAT1Q58HT5 328 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 NKAIN3Q8N8D7 197 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 OR56B1Q8NGI3 324 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 AKR7LQ8NHP1 331 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SLC19A3Q9BZV2 496 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ICAM5Q9UMF0 924 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RNF222A6NCQ9 220 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RER1O15258 196 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 LYPD3O95274 346 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 OR2C1O95371 312 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 GNRH1P01148 92 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 LCATP04180 440 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 HEXBP07686 556 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 DBHP09172 617 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 BCKDHBP21953 392 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 MGAT2Q10469 447 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 MICBQ29980 383 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 OR2A2Q6IF42 318 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 MOB3CQ70IA8 216 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SLC43A2Q8N370 569 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PRR18Q8N4B5 295 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 STT3BQ8TCJ2 826 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 XIRP2A4UGR9 3374 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 MTCP1P56278 107 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 HSD11B2P80365 405 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 HSF1Q00613 529 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF141Q15928 474 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 UQCC3Q6UW78 93 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RTN4RL2Q86UN3 420 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SLC25A42Q86VD7 318 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 MISPQ8IVT2 679 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 GLYATL2Q8WU03 294 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 NRIP2Q9BQI9 281 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD10Q9NXR5 420 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 VSIG8P0DPA2 414 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 CD37P11049 281 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 GGTLC2Q14390 218 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 FHL5Q5TD97 284 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ALKBH2Q6NS38 261 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SLC30A7Q8NEW0 376 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SLC26A10Q8NG04 563 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 OR8U1Q8NH10 309 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SLC46A1Q96NT5 459 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SPSB2Q99619 263 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 LAT2Q9GZY6 243 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PRO1933Q9H354 126 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 CHST11Q9NPF2 352 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf123Q9NWV4 160 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SLC7A11Q9UPY5 501 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 HTTP42858 3142 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 GPR37O15354 613 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RAET1LQ5VY80 246 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 LANCL3Q6ZV70 420 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 C2orf50Q96LR7 162 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 A6NIZ1 184 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 FAHP16930 419 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PPICP45877 212 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RABIFP47224 123 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 FHITP49789 147 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RAP1BP61224 184 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RAP1AP62834 184 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 DRAM2Q6UX65 266 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM123Q8N131 208 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 NELFAQ9H3P2 528 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 LPAR3Q9UBY5 353 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 IFNA2P01563 188 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 GUK1Q16774 197 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 EMC4Q5J8M3 183 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
PTPRN-201ENST00000295718 C7orf77A4D0Y5 90 aa12.9□□□□□ -0.35
PTPRN-201ENST00000295718 H3BP45 60 aa12.9□□□□□ -0.35
PTPRN-201ENST00000295718 YIF1AO95070 293 aa12.9□□□□□ -0.35
PTPRN-201ENST00000295718 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
PTPRN-201ENST00000295718 CHATP28329 748 aa12.9□□□□□ -0.35
PTPRN-201ENST00000295718 CX3CR1P49238 355 aa12.9□□□□□ -0.35
PTPRN-201ENST00000295718 HSD17B7P56937 341 aa12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms