RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mmp16Q9WTR0 607 aa16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FancmQ8BGE5 2021 aa16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10260F6YVP7 152 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 OtpO09113 325 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pou3f1P21952 449 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gsx2P31316 305 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q3KQP7 184 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CtrcQ3SYP2 268 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr9Q60885 312 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SrmQ64674 302 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Otop1Q80VM9 600 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Oxa1lQ8BGA9 433 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Asb13Q8VBX0 278 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mfsd4b1Q8VCV9 425 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pofut1Q91ZW2 393 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pnrc2Q9CR73 140 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r35Q9D8C8 260 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fstl3Q9EQC7 256 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cpn1Q9JJN5 457 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adam28Q9JLN6 793 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cln8Q9QUK3 288 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Heatr5aQ5PRF0 2038 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trav12n-2A0A075B626 113 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm28897A0A087WP44 222 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spaca5A2AE20 160 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pip5k1cO70161 661 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gabrg3P27681 467 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp987Q32P14 633 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tubal3Q3UX10 446 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hspb6Q5EBG6 162 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trav8d-2Q5R1B6 112 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AI987944Q7TPX5 406 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1113Q7TR54 326 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Stk35Q80ZW0 539 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc25a44Q8BGF9 314 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FRRS1Q8K385 592 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr815Q8VFU0 316 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr488Q8VG02 314 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem218Q9CQ44 115 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Galnt16Q9JJ61 558 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm42372A0A1B0GT27 204 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wnt9bO35468 359 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2-Ab1P01921 265 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P06344 263 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Csf1P07141 552 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rab6aP35279 208 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LumP51885 338 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tas2r136Q7TQA8 305 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1162Q7TR28 314 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiaa0895lQ810A5 467 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc24a5Q8C261 501 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrc25Q8K1T1 297 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AfmidQ8K4H1 305 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aspscr1Q8VBT9 550 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr820Q8VFU5 312 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TardbpQ921F2 414 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnttip1Q99LB0 328 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrps28Q9CY16 186 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr948Q9EQ95 321 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc30a7Q9JKN1 378 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serinc1Q9QZI8 453 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wif1Q9WUA1 379 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr485A0A140LJF5 317 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fbxw27A0A1D5RLF0 466 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ggta1l1A2AUQ7 319 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r107E9PZJ7 861 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm6465F7A7Y6 181 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PlatP11214 559 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Foxl1Q64731 336 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Neil1Q8K4Q6 389 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrc61Q8R2R5 259 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr993Q8VF75 314 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1254Q8VFB1 314 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 OxsmQ9D404 459 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zdhhc4Q9D6H5 343 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ApmapQ9D7N9 415 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Psma6Q9QUM9 246 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Insl6Q9QY05 191 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ca5bQ9QZA0 317 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc37a2Q9WU81 501 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv4-63A0A0G2JFU6 117 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10358A0A1D5RLD8 333 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wisp3D3Z5L9 354 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GapdhP16858 333 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Selenbp1P17563 472 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ArsbP50429 534 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccr1l1P51676 356 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hrh3P58406 445 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr145Q60882 310 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lcn4Q62472 185 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa-rs10Q64263 91 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ino80cQ8BHA0 191 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpr137bQ8BNQ3 385 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ldlrad4Q8BWJ4 306 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Xkr8Q8C0T0 401 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Angptl8Q8R1L8 198 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Crtac1Q8R555 646 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mitd1Q8VDV8 249 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr340Q8VGL0 312 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.9 ms