RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0U1RQV5	110 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2AT4	A6NND4	320 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	HMGN4	O00479	90 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	DIRAS1	O95057	198 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	WISP1	O95388	367 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	IL5	P05113	134 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRM4	P08173	479 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	AGTR1	P30556	359 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	THBS4	P35443	961 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MMP16	P51512	607 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	PNLIPRP2	P54317	469 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2B8P	P59922	312 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CD163	Q86VB7	1156 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SIAH3	Q8IW03	269 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	BBS10	Q8TAM1	723 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SDF2	Q99470	211 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FEV	Q99581	238 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RHCG	Q9UBD6	479 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TENM4	Q6N022	2769 aa		6.44	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ONECUT2	O95948	504 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGA5	P08648	1049 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	COL8A1	P27658	744 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CD200	P41217	278 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	KHK	P50053	298 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CDK6	Q00534	326 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC10A1	Q14973	349 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RGN	Q15493	299 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF626	Q68DY1	528 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZS92	163 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	NUBPL	Q8TB37	319 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SGCZ	Q96LD1	299 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CA10	Q9NS85	328 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAMTS20	P59510	1910 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PNR3	127 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	BLACE	A4D250	179 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FRG2C	A6NGY1	282 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R3H8	397 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZG16	O60844	167 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	DAO	P14920	347 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEB1	P43366	347 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MMP15	P51511	669 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB12	Q6IQ22	244 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CBLL1	Q75N03	491 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CLCC1	Q96S66	551 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	S100A13	Q99584	98 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	PRO1933	Q9H354	126 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TREM1	Q9NP99	234 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	DOCK7	Q96N67	2140 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MPDZ	O75970	2070 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	DUXA	A6NLW8	204 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	IFITM10	A6NMD0	228 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZAR1L	A6NP61	321 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TRDC	B7Z8K6	153 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R143	59 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38

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