RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	FGF17	O60258	216 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	MT-ATP6	P00846	226 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	TTR	P02766	147 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC25A4	P12235	298 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SYT13	Q7L8C5	426 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	OR2L13	Q8N349	312 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	FGF13	Q92913	245 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	PELI1	Q96FA3	418 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	PRRX2	Q99811	253 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	NTM	Q9P121	344 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF732	B4DXR9	585 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	UPK1A	O00322	258 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	HS3ST1	O14792	307 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC31A2	O15432	143 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	ZFPL1	O95159	310 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CST4	P01036	141 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	HPX	P02790	462 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC37A1	P57057	533 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	RAB35	Q15286	201 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CASD1	Q96PB1	797 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	STRADB	Q9C0K7	418 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC17A1	Q14916	467 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	RAB30	Q15771	203 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGDIG	Q99819	225 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CACNA1G	O43497	2377 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	PLXNB2	O15031	1838 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1W2PR64	198 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1W2PRV1	198 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CALCR	P30988	508 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	METRNL	Q641Q3	311 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	GRINA	Q7Z429	371 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	FBXL6	Q8N531	539 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	MED29	Q9NX70	200 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	TCAP	O15273	167 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	MPC2	O95563	127 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CYBA	P13498	195 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	UBE2G2	P60604	165 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC35A1	P78382	337 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	EDDM3A	Q14507	147 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	MS4A10	Q96PG2	267 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF186	Q9NXI6	227 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	TOX4	O94842	621 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	IGHV3-9	P01782	118 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CRYBA1	P05813	215 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CST2	P09228	141 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	PMCH	P20382	165 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	PTTG1IP	P53801	180 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	EDDM3B	P56851	147 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	MASP2	O00187	686 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	OR8U8	P0C7N1	319 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	RAB32	Q13637	225 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM200B-223	ENST00000622362	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.59	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms