RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ERGIC1Q969X5 290 aa24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 OPA3Q9H6K4 179 aa24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 FN3KRPQ9HA64 309 aa24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 BRD7Q9NPI1 651 aa24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 MIOXQ9UGB7 285 aa24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 OPN4Q9UHM6 478 aa24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 F5H0A9 414 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 TRAPPC2LH3BP13 241 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM20BO75063 409 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 APOC1P02654 83 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 WNT2P09544 360 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 H2BFMP0C1H6 154 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 MPPED2Q15777 294 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 GFOD2Q3B7J2 385 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 KLBQ86Z14 1044 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 CPOQ8IVL8 374 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 DEFB108BQ8NET1 73 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 OR56B2PQ8NGI1 322 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF133Q8WVZ7 376 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM246Q9BRR3 403 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 MRI1Q9BV20 369 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 LRCH1Q9Y2L9 728 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 AUP1Q9Y679 476 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 WNK2Q9Y3S1 2297 aa24.31■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 TIPRLO75663 272 aa24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 GNB2P62879 340 aa24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM236Q5W0B7 351 aa24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM57BQ71RH2 274 aa24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 NLRC3Q7RTR2 1065 aa24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 TIGD4Q8IY51 512 aa24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 C19orf18Q8NEA5 215 aa24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 THEM6Q8WUY1 208 aa24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK5Q00535 292 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF154Q13106 437 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF404Q494X3 552 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ARMCX4Q5H9R4 360 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8B3Q8NGG8 313 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 Q8TCH9 128 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 C22orf15Q8WYQ4 148 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8B2Q96RD0 313 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 AMELYQ99218 206 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 MARCH7Q9H992 704 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 A8MXK9 166 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SELENOFO60613 162 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 GRPP07492 148 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 LYNP07948 512 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF12P17014 697 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 FPR2P25090 351 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 RASSF2P50749 326 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 MZT1Q08AG7 82 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 BNIP1Q12981 228 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC16A9Q7RTY1 509 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SPERTQ8NA61 448 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8S1Q8NH09 359 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 REEP6Q96HR9 211 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 PGAM5Q96HS1 289 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC6A7Q99884 636 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SUCNR1Q9BXA5 334 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF7Q9UBF6 113 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 INSIG2Q9Y5U4 225 aa24.28■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 A6NLC8 198 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 PRODHO43272 600 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 CPT2P23786 658 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 DDOSTP39656 456 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SNAPC1Q16533 368 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF454Q8N9F8 522 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 OR52H1Q8NGJ2 320 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SGK3Q96BR1 496 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 JMJD8Q96S16 334 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 OR10A2Q9H208 303 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 C14orf119Q9NWQ9 140 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 C1orf123Q9NWV4 160 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 TVP23BQ9NYZ1 205 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-215ENST00000621029 OPRL1P41146 370 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 PITPNBP48739 271 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 BTNL3Q6UXE8 466 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 BBS1Q8NFJ9 593 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 OTOSQ8NHW6 89 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 DNAJC9Q8WXX5 260 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 SPSB4Q96A44 273 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 NRBF2Q96F24 287 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 NTN4Q9HB63 628 aa24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms