RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 RBBP4Q09028 425 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 LIN52Q52LA3 116 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 GPAT3Q53EU6 434 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 CEP78Q5JTW2 689 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 CFAP157Q5JU67 520 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 Q6ZSV7 163 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 OR6X1Q8NH79 312 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 SLC38A4Q969I6 547 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 ORAI1Q96D31 301 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 FMO2Q99518 471 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 POFUT2Q9Y2G5 429 aa5.97□□□□□ -1.45
SENP3-210ENST00000619785 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 A0A1B0GWJ7 208 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 CEACAM18A8MTB9 384 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 CENPBD1B2RD01 187 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 SPINT2O43291 252 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 GPR137BO60478 399 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 PEX11AO75192 247 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 BGLAPP02818 100 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 CRYBA1P05813 215 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 CHRNGP07510 517 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 GKN3PP0CG01 181 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 TUBG1P23258 451 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 WNT5AP41221 380 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 IER3P46695 156 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 AQP5P55064 265 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 P2RX3P56373 397 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 COPZ1P61923 177 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ANXA8L1Q5VT79 327 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 FAM91A1Q658Y4 838 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 HMGN2P46Q86SG4 172 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 PEX5LQ8IYB4 626 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ZNF101Q8IZC7 436 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 CLIP4Q8N3C7 705 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 MRAPQ8TCY5 172 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 TXNDC15Q96J42 360 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 C1orf50Q9BV19 199 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ABHD6Q9BV23 337 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ULBP2Q9BZM5 246 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 MARCH7Q9H992 704 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 A0A1W2PPM1 405 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 A4D1N5 150 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 TMEM178BH3BS89 294 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 P2RY10O00398 339 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 PLPP3O14495 311 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 RIPK2O43353 540 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 PATE4P0C8F1 98 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 PGA4P0DJD7 388 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 PGA3P0DJD8 388 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 AHCYP23526 432 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 MPV17P39210 176 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ENTPD1P49961 510 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ALDH3A2P51648 485 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 PUDPQ08623 228 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 MZT1Q08AG7 82 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ACSM1Q08AH1 577 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 FAM189A2Q15884 450 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 VWC2Q2TAL6 325 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 SLC36A2Q495M3 483 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 C10orf128Q5T292 105 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 C8orf74Q6P047 294 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SENP3-210ENST00000619785 VRK2Q86Y07 508 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms