RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598038.5

GTPBP3-216, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 5

Gene GTPBP3, Length 2,917 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-216	ENST00000598038	GRINA	Q7Z429	371 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF649	Q9BS31	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	G0S2	P27469	103 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	MAGEA5	P43359	124 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	RAB5B	P61020	215 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CDK5	Q00535	292 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038		A6NLC8	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	IFNGR1	P15260	489 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CTXN1	P60606	82 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	FOXK2	Q01167	660 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	MYBPH	Q13203	477 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PON3	Q15166	354 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TAF13	Q15543	124 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	C4orf46	Q504U0	113 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	BHLHE40	O14503	412 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SURF4	O15260	269 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PYCR1	P32322	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SLC6A8	P48029	635 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	MTNR1B	P49286	362 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	MMP15	P51511	669 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	MICB	Q29980	383 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ABHD4	Q8TB40	342 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	LURAP1	Q96LR2	239 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.71	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038		A0A1B0GWJ7	208 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	C5orf52	A6NGY3	159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	GSTM3	P21266	225 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	FCRLA	Q7L513	359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	POM121	Q96HA1	1249 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038		A0A1B0GUH1	482 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	DCTN6	O00399	190 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	TNFSF11	O14788	317 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	PNMT	P11086	282 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	ECH1	Q13011	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	OSTF1	Q92882	214 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZIC3	O60481	467 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	TXNDC12	O95881	172 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	SDHA	P31040	664 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	F2RL1	P55085	397 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	PEA15	Q15121	130 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	FGF11	Q92914	225 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	S100PBP	Q96BU1	408 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	C14orf144	Q96I85	54 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	GGACT	Q9BVM4	153 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	COLCA2	A8K830	154 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	AHSA1	O95433	338 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	CPT2	P23786	658 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	ID4	P47928	161 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP3-216	ENST00000598038	DHODH	Q02127	395 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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