RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CUBN	O60494	3623 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1B0GWJ7	208 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SELENOF	O60613	162 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF205	O95201	554 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CPT2	P23786	658 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CD200	P41217	278 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	GATA4	P43694	442 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ESRRG	P62508	458 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MIOX	Q9UGB7	285 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	DAP	P51397	102 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	APOF	Q13790	326 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	SNCB	Q16143	134 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	PHC2	Q8IXK0	858 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM165	Q9HC07	324 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	COL6A5	A8TX70	2615 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825		A6NLC8	198 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM20B	O75063	409 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	GNAL	P38405	381 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	OPRL1	P41146	370 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	GNB2	P62879	340 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCNJ8	Q15842	424 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825		Q8TCH9	128 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR8B2	Q96RD0	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRI1	Q9BV20	369 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	RGCC	Q9H4X1	137 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	FSTL3	O95633	263 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	GRP	P07492	148 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	WNT2	P09544	360 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	EPHA1	P21709	976 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM3A	P98173	230 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	MPPED2	Q15777	294 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms