RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-205ENST00000589649 GIPC3Q8TF64 312 aa20.48■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 RAB40AQ8WXH6 277 aa20.48■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 ERGIC1Q969X5 290 aa20.48■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 THTPAQ9BU02 230 aa20.48■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 CMC2Q9NRP2 79 aa20.48■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF878C9JN71 531 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 H3BN98 237 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 TBX1O43435 398 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 FSTL3O95633 263 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 BTNL3Q6UXE8 466 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 CD300LDQ6UXZ3 194 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF841Q6ZN19 808 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF826PQ6ZT77 177 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 DOK3Q7L591 496 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 DPY19L4Q7Z388 723 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 PLEKHA8Q96JA3 519 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 AMELYQ99218 206 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 SLC22A4Q9H015 551 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 FN3KRPQ9HA64 309 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 RNF7Q9UBF6 113 aa20.47■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 C3orf80F5H4A9 247 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 GMDSO60547 372 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 GRPP07492 148 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF3P17036 446 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 POU1F1P28069 291 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 CX3CR1P49238 355 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 NLRC3Q7RTR2 1065 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 PARP8Q8N3A8 854 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 C3orf56Q8N813 242 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 ABHD6Q9BV23 337 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 C1orf123Q9NWV4 160 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 CLN8Q9UBY8 286 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-205ENST00000589649 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 CPT2P23786 658 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 GRK5P34947 590 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 HS3ST5Q8IZT8 346 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 SGK3Q96BR1 496 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 INTS14Q96SY0 518 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 OR51V1Q9H2C8 321 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 CTSZQ9UBR2 303 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 C22orf46C9J442 243 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 GSTT1P30711 240 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 PSMB10P40306 273 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 BAMBIQ13145 260 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 FAM57BQ71RH2 274 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 UPRTQ96BW1 309 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 C1orf21Q9H246 121 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 BRD7Q9NPI1 651 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF319Q9P2F9 582 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 TRAV40A0A0B4J280 105 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 LGALS8O00214 317 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 GNGT2O14610 69 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 XRCC2O43543 280 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 PRKACGP22612 351 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 HSD11B1P28845 292 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 BLVRAP53004 296 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 GRB2P62993 217 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 FAM3AP98173 230 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 POU4F2Q12837 409 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 GINS1Q14691 196 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 OR8B8Q15620 311 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 AWAT1Q58HT5 328 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 SLC16A9Q7RTY1 509 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 SPSB4Q96A44 273 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 TECTBQ96PL2 329 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 A6NLC8 198 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 GLCEO94923 617 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 PRTN3P24158 256 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 SLC15A1P46059 708 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 FGF12P61328 243 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 TIGD6Q17RP2 521 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-205ENST00000589649 GFOD2Q3B7J2 385 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms