RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, human

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIC-208	ENST00000589537	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TMEM165	Q9HC07	324 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	GSC2	O15499	205 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	AVP	P01185	164 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	WNT2	P09544	360 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	CA6	P23280	308 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OR8B2	Q96RD0	313 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	RGCC	Q9H4X1	137 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	MED20	Q9H944	212 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF12	P17014	697 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	FPR2	P25090	351 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OPRL1	P41146	370 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PRSS12	P56730	875 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OPN4	Q9UHM6	478 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TBX1	O43435	398 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	FSHB	P01225	129 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	LYN	P07948	512 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SLC2A1	P11166	492 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ADRA2C	P18825	462 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	HILS1	P60008	231 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	GNB2	P62879	340 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF154	Q13106	437 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SPATC1	Q76KD6	591 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PHYH	O14832	338 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	NDUFA2	O43678	99 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	FAM20B	O75063	409 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PRKACG	P22612	351 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PMEL	P40967	661 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ESRRG	P62508	458 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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