RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTR6Q9GZN1 396 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHA1Q9HB21 404 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 MEGF11A6BM72 1044 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD61A6NGH8 418 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF20P17024 532 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM27E3Q08E93 113 aa26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 GLYATL3Q5SZD4 288 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf63A6NC05 138 aa26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 CEP78Q5JTW2 689 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 SFXN4Q6P4A7 337 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRTM1Q86UE6 522 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ACOT12Q8WYK0 555 aa26.86■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa26.85■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 PPP3CBP16298 524 aa26.85■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 PPP3R1P63098 170 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 FJX1Q86VR8 437 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf174Q8IYL3 243 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 PP6455Q8WZ26 134 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 V9GY05 133 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR14LQ5THK1 2151 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JK05 382 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 AGFG2O95081 481 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBG1P23258 451 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 TAB1Q15750 504 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB37Q5TC79 503 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 NR2C2APQ86WQ0 139 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 NKAIN3Q8N8D7 197 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2AE1Q8NHA4 323 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC46Q96FV0 321 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBG2Q9NRH3 451 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 WNT5AP41221 380 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ADORA2A-AS1P86434 159 aa26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 ASPHD2Q6ICH7 369 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF529Q6P280 563 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 LILRB4Q8NHJ6 448 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D15Q8TC07 691 aa26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 PEX16Q9Y5Y5 336 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 ALX3O95076 343 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 CECR9P0C854 216 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 EPXP11678 715 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 CCKARP32238 428 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 CAV3P56539 151 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM3AP98173 230 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF92Q03936 586 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 IGSF10Q6WRI0 2623 aa26.82■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 MAS1P04201 325 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 C4orf17Q53FE4 359 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 MZT2AQ6P582 158 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 UTS2BQ765I0 119 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGLQ9Y2B2 252 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 STARD10Q9Y365 291 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM30A4D0T7 59 aa26.81■■□□□ 1.88
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